Cell | 免疫疾病里免疫细胞特异基因调控动态全景图

筑波大学的比对其他部门和RIKEN Research比对所的同事们已经建立了首个针对自身致病性登革热和自身瘙痒性登革热的基因基因组数据资料库。渴望这一海洋资源能为致病登革热的蓬勃发展提供新的论调，并可能有助于类固醇的发现。地质学家们还渴望，与致病系统地的基因基因组组数据资料研究成果之后可能应用于诸如COVID-19等登革热的比对。

筑波大学项目比对助理，流行病学风湿病学家，系统基因基因组组学专家Mineto Ota博士说道：“要认识到登革热，就不必深刻理解基因基因组人体内的系统。有了这个数据资料集，我们就可以将与登革热系统地的DNA基因组变化的数据资料与对登革热得病功能愈来愈为重要的基因基因组和线粒体类别联系起来。”Ota是该设计团队发表在《Cell》华尔街日报上的文章的主要笔记，文章标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的地质学家们密切合作进行的。

笔记说道，致病激活的登革热（IMD）还包括从自身致病性到自身瘙痒的多种病理。他们提到，尽管IMD中所炎性线粒体因子的异常活动得出结论致病线粒体系统发生了变化，但是，“对于IMD的系统地基因基因组甚至系统地线粒体类别知之甚少。”

同类别基因基因组组系统地联比对（GWAS）发现了许多与IMD系统地的基因基因组组启动子。但是，在此类系统地联比对中所比对出的许多基因基因组人体内都座落调节基因基因组“on”或“off”强调的DNA非UTF-区域，而不是座落基因基因组UTF-基因组中所。比对人小组提到：“GWAS已经揭示了许多与精细人体内和登革热系统地的基因基因组组启动子，还包括IMD。这些人体内中所的大多数都座落非UTF-基因基因组组区域，特别是在是管控元件，如增强子和启动子。”

为了揭示管控DNA的系统，一种相异类别的基因基因组组比对，称为强调基本原理人体内基因基因组启动子（eQTL），旨在将DNA基因组的差异与基因基因组强调的差异联系起来。借助eQTL数据资料，比对其他部门可以对管控DNA基因组的借以、管控基因组中所的人体内如何影响其管控基因基因组的强调以及这些基因基因组强调差异如何致使登革热做出愈来愈明智的猜测。

其它针对致病的eQTL比对已经在进行中所，但先前的比对只还包括健康志愿，并检查了受限数量的线粒体类别。比对其他部门说道：“对健康供体致病线粒体的比对可能不会捕获登革热完全下发现的一系列eQTL效应。此外，虽然对致病线粒体的实验性刺激可以在某种程度上模拟登革热完全，但并不总是突显出体内的认知自然环境。”

Ota说明道：“瘙痒完全下，致病线粒体的物理学特性与健康完全下的相同线粒体截然相异。与致病情况下系统地的基因基因组人体内可能只在患病完全下起作用，因此对于这种类别的基因基因组比对，从真实病变额头借助样本愈来愈为重要。”

在他们最新报道的比对中所，比对人小组对79名健康志愿和337名被治疗患有10种相异类别致病激活登革热（还包括类风湿性关节炎、系统地红斑狼疮和系统地硬化症）的病变进行了同类别基因基因组组测序。所有志愿都是日本血统。

认识到致病激活的登革热很强挑战性，因为尽管每种登革热在流行病学上都是相异的，但仍有许多重叠之不远处，并且很强相同治疗的病变才会表现出愈来愈为相异的症状。比对其他部门说明说道：“由于所有这些多元性，一次研习一种致病激活登革热的能力是受限的。但是，如果我们两兄弟比对10种登革热，就可以愈来愈同类别面地认识到这些类别的登革热。”

在顺利进行同类别基因基因组组测序后，比对其他部门从志愿的血液样本中所分离出28种相异类别的致病系统地线粒体，并量度了这些线粒体中所的基因基因组强调。“我们在研究成果中所看到，每种致病线粒体类别都有相异的eQTL结果，这可以告诉我们线粒体类别之间基因基因组管控的差异，以及哪种线粒体类别对于蓬勃发展哪种登革热至关重要。”比对其他部门说道。

笔记报告说道，“在基因基因组强调比对中所，我们在一个跨平台上对多个IMD进行比较，使我们需要描述每个登革热（病变）的特征，并识别与单个登革热线粒体系统地的基因基因组，以及在各别IMD中所失调的通路……我们的数据资料集使我们需要检测每个特定线粒体类别中所eQTL效应的认知（登革热）背景驱动的干扰。”

比对其他部门将赢取的海洋资源命名为筑波大学致病线粒体基因基因组强调研究成果（ImmuNexUT），并说道它代表了使用东亚血统志愿建立的远超过的eQTL数据资料集。他们总结道：“我们确定了致病线粒体类别线粒体的eQTL效应，还包括实际上未有报道的罕见线粒体类别，它们在认知瘙痒必须下的多元性，以及这些eQTL与IMD基因突变之间的显著系统地联。”

“到目前为止，在这一领域，大规模的基因基因组组和系统基因基因组组比对主要是借助北美这些年来进行的，尽管社会阶层多元性对于精确理解基因基因组组系统至关重要。”比对其他部门说道，“这个日本受试者的eQTL研究成果对于克服这种以北美为中所心的偏见，结合北美的数据资料集进一步比对DNA人体内的系统，也很强重要意义。”

比对其他部门渴望ImmuNexUT数据资料库将在此之后增长，并之后为病变带来愈来愈好的结果。他们说道：“与以后报道的海洋资源相比，我们的数据资料集很强独特而有利的特点，还包括同类别面的致病线粒体划分、这些年来之间致病情况下的变化以及同质的非北美这些年来。”